針對知識產權糾紛數量大幅攀升，當前在知識產權維權過程中存在周期長、成本高、賠償低、效果差等問題，嚴重挫傷創新主體的積極性，煙臺保護中心探索建立行政執法協作、司法保護、調解、仲裁等協同保護體系，建立多元化糾紛解決機制，構建了全市乃至跨區域的知識產權大保護工作格局。

煙臺保護中心同青島市中級人民法院共同簽訂《關于跨區域知識產權保護合作的框架協議》，建立全省第一家跨地域知識產權糾紛訴調對接綜合服務平臺，成功調解4件案件，訴調對接成效初顯；成立煙臺市知識產權糾紛人民調解委員會和煙臺市知識產權仲裁中心，并組建由23家協作單位和70位專家組成的智庫，強化國內外知名專家對仲裁和調解工作的智力支持；建立知識產權侵權糾紛檢驗鑒定工作體系、制定業務規范、建設工作隊伍、形成可復制推廣的工作模式；與煙臺海關等行政執法部門簽署《知識產權協同保護合作協議》，建立知識產權協同保護機制；建立覆蓋全市28家知識產權保護分支機構，形成中心—分中心—工作站三級維權援助服務網絡。