注冊商標停止使用的正當理由主要有以下幾點：

（1）不可抗力。不可抗力是不能預見、不能避免并不能克服的客觀情況。一般指地渠、合風等自然災害和戰爭等情況。如果這些因素發生，導致生產經營無法進行，進而導致商標無法使用的，構成正當理由。

（2）政府政策限制。由于政府政策的存在，特定的商品的生產銷售無法進行，導致商標無法使用。政府政策限制一般包括政府禁止特定種類的商品銷售禁令、進出口限制、生產經營前置性審批或許可等。在“GNC”商標撤銷案中，商標權人就主張，魚油類產品屬于保健食品，應當經過衛生部的審批才能進行生產銷售，由于無法獲得審批，所以無法使用商標。

（3）破產清算。企業進入破產清算程序后，不能再進行生產經營，因此自然無法正常使用商標。